2000/03/11 ダイヤ改正において佐世保発着のあかつき号が廃止されます。佐世保発着あかつき号廃止に伴って、「あかつき」号は京都－長崎間の列車のみとなり、京都－門司間は「彗星」号と併結されることになります。「あかつき」「彗星」併結に伴って、彗星号は新大阪発着から京都発着に変更されます。佐世保発着あかつき号に連結されていたＢ寝台個室「ソロ」は彗星号に連結されます。
札幌－稚内間を運行していた急行利尻が札幌－稚内間に特急スーパー宗谷号の登場と併せて特急利尻号に変更されます。
その他、山陽新幹線新大阪－博多間にひかりRail Starが登場し、最高速度285km/hで運転されます。また、東海道・山陽新幹線では食堂車の営業が無くなります。